В музее «Городская управа» посетители могут познакомиться с постоянной экспозицией под названием «Наш край в древности». Эта выставка привлекает внимание как взрослых, так и детей. Одной из самых увлекательных частей экспозиции является палеонтологическая коллекция. Благодаря ей можно узнать о фауне, населявшей территорию Ишимского района много столетий назад, и даже потрогать настоящий зуб доисторического животного. Коллекция «Палеонтология» насчитывает 95 предметов. Бо́льшая часть этих экспонатов была найдена случайно и передана в музей местными жителями.
В этой коллекции представлены кости мамонтов и их фрагменты. Среди них уникальны верхняя и нижняя челюсти мамонта, найденные в деревне Мало-Удалово в 2001 году. Возраст этих находок составляет 38 тысяч лет. Самый крупный фрагмент мамонта в коллекции — это верхняя часть черепа с зубами и фрагментами бивней. Он был обнаружен в 2006 году спасателями Ишимского отряда МЧС в реке Ишим возле Синицынского бора. Вес этой находки составляет 300 килограммов, а длина достигает 180 сантиметров — можно предположить, что это останки взрослого животного. Коллекция также включает останки млекопитающих четвертичного периода, таких как бизоны и древние лошади.
В коллекции также есть немногочисленные костные останки шерстистого носорога. Среди них выделяются два фрагмента черепа. Особенно интересна плечевая кость эмбриона шерстистого носорога.
Кроме того, в палеонтологической коллекции музея есть редкие образцы, найденные в соседних с Тюменской областью регионах Северного Казахстана. Например, в 1994 году в Кустанайской области были обнаружены окаменелые раковины гастроподы и брахиоподы, которые также представлены в экспозиции.